События разворачиваются спустя два года после легендарной битвы в Мишн Сити. Юный Сэм Уитвикки, спасший когда-то мир от вторжения, стремится к простому будущему: поступление в университет и попытка забыть о роботах-воинах. Однако прошлое не отпускает — его верный страж Бамблби, а вместе с ним и другие Автоботы, остаются его незримыми защитниками.
Третья часть популярной семейной франшизы знакомит зрителей с новой главной героиней — дочерью Джона Дулиттла по имени Майя. Девушка, живущая в тени прославленного отца, неожиданно осознаёт, что унаследовала его уникальную способность понимать язык животных. Стремясь к самостоятельности и поиску своего места в мире, Майя решает уехать на тихое ранчо, принадлежащее старому другу семьи.
Молодой студент колледжа Мэтью переживает один из тех редких моментов, когда жизнь дарит нечто волшебное. В полутьме сломавшегося лифта он проводит ночь с очаровательной и таинственной девушкой, с которой находит неожиданную духовную близость. Утром, придя в себя, он осознаёт главную трагикомическую деталь: в кромешной темноте он так и не увидел её лица.