Япония конца XIX века, десять лет после войны Босин. Страна стремительно вестернизируется, сословие самураев упразднено, а ношение катаны запрещено. Бывший самурай Сюдзиро Сага, похоронивший дочь, павшую жертвой холеры, сталкивается с отчаянием: его жена умирает, а родная деревня нуждается в помощи.
Фильм «Шоколад» — это напряжённая драма, переплетённая с яркими боевыми сценами, где прошлое настигает героиню в самый неожиданный момент. Зин, оставившая криминальное прошлое ради любви к японцу из Якудзы, вынуждена однажды скрыться, даже не сообщив ему о беременности. Спустя годы, воспитывая дочь Зэн,diagnoзированную аутизмом, она получает удар судьбы — собственный смертельный диагноз.