События фильма разворачиваются спустя два года после финала аниме-сериала «Стальной алхимик», когда Эдвард Элрик оказался заперт в нашем мире, в Мюнхене 1923 года. Лишившись возможности использовать алхимию, он посвящает себя исследованиям в области ракетной техники, работая вместе с молодым Альфонсом Хайдерихом, который невероятно похож на его младшего брата — эти труды должны помочь ему...
