Майл Моралес — обычный подросток из Бруклина, который только недавно перешел в новую школу, скучает по отцу и пытается вписаться в новую компанию, пока однажды его не кусает радиоактивный паук. С этого момента у парня появляются невероятные способности: он может лазить по стенам, чувствовать опасность на расстоянии, выпускать паутину, но сначала он не понимает, что происходит, и прячет свои...
Знакомые по первому фильму обитатели нью-йоркского зоопарка — лев Алекс, зебра Марти, жираф Мелман и бегемотиха Глория — снова оказываются в невероятных приключениях. Не выдержав излишней комфортной жизни на острове Мадагаскар, друзья решают вернуться домой, в Нью-Йорк. Однако их самодельный самолет терпит крушение, и вся компания вновь оказывается в совершенно неожиданном месте — на просторах...
Фильм стал полнометражным продолжением не дошедшего до финала культового сериала «Светлячок», автором сценария и режиссером которого выступил Джосс Уидон. Действие разворачивается в XXVI веке, когда под властью межпланетного Альянса находится большая часть обитаемых миров, а на окраинах космоса живут люди, которые предпочитают не подчиняться центральному правительству.