Фильм «Питер Пэн и Алиса в стране чудес» предлагает взглянуть на истоки двух культовых сказок, соединяя их в одну трогательную историю о детстве и семье. Ребятёнок Алиса и её старший брат Питер живут в доме, где реальность переплетается с вымыслом благодаря своим родителям. Мать, полная нежности и заботы, и отец, чей ум — постоянный фантазёр, дарят детям самое ценное: веру в чудо.
Вторая часть истории о взаимоотношениях королевского семейства и волшебного народа, события которой разворачиваются спустя несколько лет после того, как Малефисента помирилась с Авророй и подарила девочке свою любовь и защиту. Принцесса выросла, стала правительницей Молочного леса, и теперь готовится к свадьбе с принцем Филипом — союз, который обещает объединить два королевства и навсегда...