Сериал «Призраки» погружает в мир, где граница между реальностью и необъяснимым стирается. Главные герои — Лерой Райт, циник и бывший агент ФБР, и Макс Эллисон, обладающий экстрасенсорными способностями и безоговорочно верящий в потустороннее. Их объединяет тайное правительственное агентство, которое поручает им расследовать странные и пугающие случаи в Лос-Анджелесе.
Действие разворачивается в недалёком будущем, где часть Лос-Анджелеса оказалась под контролем неизвестных пришельцев, отгороженная мощным забором и превращённая в «колонию». В этом закрытом мире живёт семья Боумэн: бывший агент ФБР Уилл, его супруга Кейти и их дети. Их мир рушится, когда старший сын Чарли оказывается по ту сторону забора, в зоне, куда вход запрещён.
Двенадцатилетний Макс живёт в сложном мире: в школе его терроризируют хулиганы, а дома мама, пытаясь построить новую жизнь, привела нового мужчину, который мальчику кажется чужаком. Его главная мечта — воссоединение родителей, но она кажется всё более недостижимой. Однажды, спасаясь от очередной облавы, Макс прячется в заброшенном доме и случайно освобождает из заточения могущественного джинна...
Нью-Йорк, рождественские огни, размеренная жизнь сотрудника метрополитена Люси. Её миром владеет тихий, но настойчивый порыв — смотреть каждое утро на одного и того же незнакомца, выходящего из поезда. Случай, почти волшебный, сводит их: она спасает его от поезда. Этот поступок становится ключом к новой, неожиданной реальности.
1969 год, Вьетнам. Два американских солдата — Люк, неспособный стрелять в безоружных, и Скотт, чья жестокость граничит с безумием, — становятся живыми воплощением противоположностей. Их первая встреча закладывает фундамент ненависти, которая не угаснет и через десятилетия. Современность. Правительство запускает сверхсекретный проект «Универсальный солдат».