В преддверии Хэллоуина в тихом городке Салем начинают происходить странные события. Хьюби Дюбуа, местный житель, который каждый год с тщанием следит за порядком во время праздника, случайно становится свидетелем похищения. Проблема в том, что его постоянные звонки в полицию и бдительность уже превратились в городскую шутку, и теперь ему не верят.
Метро-Сити уже много лет живет в противостоянии гениального, но крайне невезучего злодея Мегамозга и непобедимого супергероя Метро-Мэна. Каждая хитроумная попытка злодея захватить город заканчивается позорным провалом, но однажды ему наконец удается одолеть заклятого врага. Теперь Мегамозг остается без главной цели в жизни, и скука заставляет его придумать новый амбициозный проект: он решает...