Любимый морской обитатель Бикини Боттом вновь оказывается в центре невероятных событий. Когда Губка Боб теряет свои уникальные квадратные штаны — символ его индивидуальности, — он не может сидеть сложа руки. Вместе с вечно оптимистичным Патриком Старом он пускается в опасное путешествие по самым неизведанным и мрачным уголкам океанского дна.
После неудачной перестрелки профессиональный киллер попадает под машину и оказывается в больнице, где полиция берёт его под стражу. Его младний брат, понимая, что брата ждёт тюрьма или worse, решает действовать радикально. Он похищает беременную жену врача, который ухаживает за раненым киллером, и ставит того перед выбором: помочь сбежать или потерять семью.