Аниме-сериал «Шарлотта» погружает в мир, где у определённых подростков проявлются уникальные паранормальные способности, часто неконтролируемые и связанные с их личными травмами или желаниями. Главный герой, Ю Отосака, обладает силой, которая в теории могла бы сделать его суперзлодеем, но он сознательно выбирает путь обычного школьника, используя свои таланты лишь для мелких хитростей.
Шестеро неразлучных друзей детства теряют свою объединяющую силу — Мэйко Хомму, самую добрую и обаятельную из них. Её внезапная смерть становится невыносимым ударом, и компания, не сумев преодолеть общую боль, распадается. Каждый из бывших друзей, чувствуя себя чужим в прежнем кругу, отправляется в самостоятельное путешествие: кто-то уезжает покорять большой мир, кто-то поступает в элитный...
История шестерых друзей детства, которые в младших классах называли себя «супермиротворцами» и вместе исследовали окрестности родного городка, пока трагическая смерть их подруги Мэйко Хомма не разорвала компанию. Дзинта, который был неформальным лидером группы, всю вину за случившееся взял на себя, ушёл в затворничество и перестал общаться со всеми бывшими товарищами, став классическим хикикомори.